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最好選擇兩個不同種源的抗體。選擇同一種源的抗體的問題在于:在WB之前進(jìn)行的蛋白變性這一步,由于加樣緩沖液中含有巰基乙醇,巰基乙醇會把抗體的重鏈和輕鏈之間的二硫鍵破壞,從而使的抗體變成重鏈分子55KD和輕鏈分子25KD。假設(shè)你IP的抗體是兔抗的,目的蛋白進(jìn)行WB的抗體也是兔抗的,而且目的蛋白的分子量為55KD,可以想象,55KD的位置除了你的目的蛋白以外,還有IP抗體的重鏈IgG。由于IP的抗體用量非常大(1ug),就導(dǎo)致55KD處的信號會非常強(qiáng)。如果你用抗兔的二抗進(jìn)行顯色,那么55KD處的ip抗體的重鏈和你的目的蛋白會重疊在一起,無法分辨。
然而這個時候如果你的目的蛋白進(jìn)行WB的抗體不是兔抗的,比如小鼠抗的,那么就需要用抗小鼠的二抗進(jìn)行顯色,而抗小鼠的二抗是無法跟兔抗的IP抗體發(fā)生反應(yīng)的。因此55KD位置的IP抗體的重鏈IgG就無法顯色,發(fā)生反應(yīng)的就是你的目的蛋白了。

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